écosystème

UMR 7025 - GEC

Génie Enzymatique et Cellulaire

Le laboratoire dispose des équipements lourds nécessaires à la réalisation de ses recherches, en conformité avec les réglementations internationales concernant l'éthique, l'hygiène et la sécurité. Ces équipements appartiennent en propre à l‘Unité ou résultent d'une mise en commun de moyens avec d'autres laboratoires de l'UTC. L'Unité dispose également d'une instrumentation performante pour l'enzymologie, la biologie moléculaire, l'immunologie, la biologie végétale, la purification et la caractérisation des molécules biologiques.

Le laboratoire L2

Nous disposons d'un laboratoire de confinement L2, pour la manipulation des agents biologiques faiblement pathogènes pour l'homme. (Ce laboratoire a pour rôle d'assurer une maîtrise de la contamination biologique, c'est-à-dire une protection des chercheurs et de l'environnement vis-à-vis des agents qui y sont manipulés.). Ce laboratoire est constitué de huit salles en dépression et équipées de systèmes de filtration adaptés. Il s'agit de 2 salles de culture animale, une salle de microbiologie, une salle de culture végétale, une salle de fermentation, une salle de radioactivité, une salle de biochimie et une salle d'incubation. Ces pièces sont complétées d'une chambre froide. Toutes les manipulations qui le nécessitent sont faites sous des postes de sécurité microbiologique de niveau II (cinq postes). Le laboratoire comprend également un vestiaire et une laverie avec autoclave et système de filtration d'eau milliq. Le matériel contenu dans le laboratoire permet de réaliser toutes les étapes allant de la culture de cellules jusqu'à l'extraction de molécules d'intérêt (acides nucléiques, protéines) et à leur analyse.

Principaux équipements :

Enceintes à CO2 | Incubateurs thermostatées | Phytotron | Centrifugeuses réfrigérées | Congélateur à -80° | Appareils d'éléctrophorèses | Appareil PCR | Analyseur d'écran phosphore stimulable (Cyclone) | Compteur à scintillation à microplaques (microbeta Trilux).

La serre S2

La serre S2 (niveau 2 de confinement) permet une maîtrise des risques de dissémination des plantes OGM et garantit ainsi une protection de l'environnement. Elle répond aux exigences de confinement des plantes OGM et microorganismes associés émises par la Commission de Génie Génétique. La serre S2 est une zone confinée dont l'accès est réservé aux personnes formées aux pratiques sécuritaires de manipulation des OGM et au traitement des déchets produits.
La zone de confinement est accessible par un sas d’entrée et de sortie dans lequel le personnel dispose de l'équipement vestimentaire (blouses vertes, sur-chausses) nécessaire pour ne pas être vecteur de contamination par dissémination de pollens et/ou graines et de passage d'insectes pollinisateurs dans l'environnement externe. La zone confinée donne accès à trois salles de cultures (phytotrons) dont les conditions environnementales (photopériode, luminosité, hygrométrie et température) sont contrôlées indépendamment. La serre S2 est un lieu de culture et de manipulations des plantes OGM. Le personnel habilité a reçu une formation spécifique afin de connaître les pratiques à respecter en matière de manipulation des plantes OGM et de traitement des déchets, ceci afin d'écarter tout risque de contamination de l'environnement extérieur, par du matériel biologique OGM végétal et microbien.

Principaux équipements :

Autoclave pour la stérilisation des déchets biologiques solides |Poubelles à déchets biologiques |Système de filtration des effluents de nettoyage pour la rétention des graines |Bacs de rétention des effluents pour le traitement destructif des bactéries et pollens.

Plateforme Biologie Cellulaire

La plate-forme de biologie cellulaire est destinée à fournir un outil de travail à différentes équipes impliquées dans des projets où interviennent des opérations de culture cellulaire. Elle est dédiée à des travaux requérant un niveau de confinement L1. Elle représente une mise à disposition de moyens à destination d'utilisateurs externe à la plateforme. Le maintien et l'entretien de la plateforme sont sous la responsabilité d'une équipe permanente. Cette équipe est chargée de concevoir, d'améliorer et de faire respecter des règles d'utilisation pour un fonctionnement harmonieux de cet outil de travail. Le laboratoire est géré par un comité scientifique composé de quatre membres représentatifs à la fois de l'équipe permanente et des utilisateurs externe. Le comité scientifique est animé par le responsable scientifique de la plateforme.  Le comité scientifique vérifie la conformité des projets proposés par les utilisateurs avec les performances de la plateforme. Les utilisateurs désireux de profiter des performances de la plateforme de biologie cellulaire doivent déposer un projet de travail.

Principaux équipements :

Autoclave Getinge modèle LAB-10-001 Subtil Crépieux | Appareils pour western blot Biorad SDS-PAGE | Centrifugeuse Eppendorf 5804R | Centrifugeuse ThermoScientific Heraeus Biofuge primoR | Congélateur -80°C Innova U535 New Brunswich Scientific | Container de cellules cryopréservées Locator Thermolyne 4 plus | Cytomètre en flux Gallios Beckman coulter | Four Poupinel Binder ED 115 | Incubateurs à CO2 *6 | Appareil de microencapsulation à jet d’air coaxial |
Appareil de microencapsulation/immobilisation Nisco Var D | Microscope à épifluorescence Leica DMI6000 | Microscopes inversés à contraste de phase OLYMPUS CKX41 | Postes de sécurité microbiologiques de type II *4 | Spectrofluoriluminomètre SPARK M10 TECAN | Spectrofluorimètre Spectrafluor Plus TECAN.

Plateforme Analytique

Au sein de la Plateforme Analytique sont réunis l'ensemble des moyens analytiques de caractérisation biochimique et spectroscopique, utilisés dans le cadre des activités de recherche.

Principaux équipements :

Zetasizer Nano-ZS Malvern | Spectrophotomètre FT-IR Nicolet 6700 Thermo Scientific | Spectrofluorimètre Fluorolog 3 Horiba | Spectrofluorimètre Cary Eclipse Varian | Spectrofluorimètre POLARstar BMG Labtech | Spectrophotomètres Uvikon XS |Mesure par Résonance Plasmonique de Surface (Biacore T100 et Biacore X) | Microscope Modulaire alpha300 Witec | Microscope à Force Atomique AFM | Microscope Optique en Champ Proche SNOM | Microscope Confocal Raman à Balayage | Spectromètre de Résonance Magnétique Nucléaire RMN Avance DSX 400 (Bruker).

Plateforme Spectrométrie de Masse

La plateforme se compose de 4 spectromètres de masse en couplage avec des systèmes de séparation par chromatographie liquide ou gazeuse. Les spectromètres de masse triple quadripolaire et hybride Q-TOF sont munis de source électrospray et APCI. Ils peuvent être couplés à une HPLC capillaire ou une HPLC rapide en fonction des applications et de la quantité d'échantillons disponible. Le spectromètre de masse triple quadripolaire est particulièrement adapté aux dosages des petites molécules présentes en faible quantité dans des matrices complexes, alors que le spectromètre de masse hybride haute-résolution permet une identification fiable de composés inconnus de part sa précision en masse, inférieure au ppm et à sa haute résolution.  Les échantillons volatils peuvent être traités par couplage en chromatographie phase gazeuse. Ils sont identifiables à l'aide d'un spectromètre de masse simple quad ou triple quad pour les quantifications. En fonction des objectifs, nous pouvons ioniser les molécules à l'aide de l'impact électronique ou en ionisation chimique.

Principaux équipements :

LC-MS/MS Triple quadripôle Agilent 6460 |LC-MS/MS Q-TOF Agilent 6538 |GC-MS/MS Triple quadripôle Thermo QUANTUM  |GC-MS Simple quadripôle Shimadzu QP2010 |Chaînes de chromatographie liquide équipées de différents type de détecteur (ELSD, RI, DAD, ESI-Q) | Chromatographe en phase gazeuse avec détection par FID.
Génie Enzymatique et Cellulaire

Directeur du laboratoire GEC
Karsten Haupt
Tél : 03 44 23 44 55 | Contacter par mail

Secrétariat
Morgane Luppi
Tél : 03 44 23 44 16 | Contacter par mail

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