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Yannick ROSSEZ Chercheur CNRS

| Génie Biologique (GB) | Génie Enzymatique et Cellulaire

Compétences clés

electrophoretic techniques western blotting phage display immunohistochemistry chromatographic techniques cell culture molecular biology
La résistance croissante des bactéries aux antibiotiques figure parmi les menaces les plus graves pesant sur la santé de la population mondiale : à l'horizon 2050, si rien n'est fait pour l'enrayer, elle pourrait entraîner quelque dix millions de décès par an sur la planète*, davantage que toutes les formes de cancers réunies.

Au laboratoire génie enzymatique et cellulaire (GEC) de l'UTC, Yannick Rossez travaille sur cet enjeu majeur. Son ambition ? Trouver une alternative à ce type de traitements : "Les bactéries, qui ont des milliards d'années d'adaptation derrière elles, sont capables de développer en permanence de nouvelles stratégies pour survivre. Plutôt que d'essayer de les tuer avec des antibiotiques auxquels elles parviennent à s'adapter de plus en plus vite, l'idée est de les empêcher de devenir pathogènes."

Concrètement, pour provoquer une maladie, il faut d'abord que les micro-organismes adhèrent à un tissu cellulaire, qu'ils vont ensuite coloniser en se multipliant et en se collant les uns aux autres. Ils forment alors un biofilm qui contribue également à leur survie. Car non seulement les antibiotiques se heurtent à la résistance naturelle des bactéries, mais elles ne peuvent pas atteindre toutes celles qui composent le biofilm. "Pour empêcher ce processus, la solution la plus efficace serait de le bloquer dès sa phase initiale, explique Yannick Rossez. Autrement dit, de chasser les micro-organismes avant qu'ils n'adhèrent au tissu, ce qui suppose de bien comprendre les mécanismes en jeu. Certaines bactéries, par exemple, disposent de flagelles : de petits tentacules leur permettant de se mouvoir dans un milieu liquide, mais aussi de sonder un support et de s'y accrocher. Nous étudions le mécanisme de pénétration du flagelle dans un tissu, mais aussi l'évolution du métabolisme de la bactérie lorsqu'elle adhère au tissu pour voir si elle libère des molécules spécifiques. Ensuite, il s'agira de synthétiser des molécules chimiques résistantes capables d'inhiber ce processus et face auxquelles les bactéries auront beaucoup plus de mal à développer une stratégie d'adaptation que lorsqu'on cherche à les tuer avec un antibiotique."

* Source : The review on antimicrobial resistance, sous la direction de Jim O'Neill, mai 2016.

Research

Member of the theme “Plant Metabolism and Bioresources”.
Specialised in host-pathogen interaction and molecular characterisation by mass spectrometry, my interdisciplinary research is focused on bacterial adherence on plant and animal tissues. What I have done up till now is elucidating complex questions regarding bacterial adhesion and metabolic adaptation. For exemple, I have characterised the ligands of three different bacterial adhesins (LabA from Helicobacter pylori, ECP and flagella from E. coli). I have deciphered the pattern of glycosylation of H. pylori protein target.
 
Skills

  • Biochemistry and cellular biology: electrophoretic techniques (SDS-PAGE, agarose), western blotting, phage display, immunohistochemistry, chromatographic techniques (HPLC, FPLC, GC, gel permeation), animal experimentation, cell culture (stimulation and transfection), ELISA development, molecular biology.
  • Structural biology: glycomics, lipidomics, metabolomics, mass spectrometry techniques: MALDI-TOF/TOF and ESI-MS/MS (Q-TOF).
 
Roles and responsabilitie

Since 2016, co-leader to one of the two theme in the GEC laboratory (regrouping 13 researchers and 5 technical staffs).
 
General information

  • 2008-2011: PhD University of Technology of Lille 1, UGSF. Mentors: Jean-Claude Michalski and Catherine Robbe-Masselot. My first key step in academic research, where I learned about mass spectrometry (MS) and how to identify complex molecules after fragmentation (MS/MS). The subject of my dissertation was mucin glycosylation in human stomach and the implication of O-glycans in Helicobacter pylori adhesion to the gastric mucosa. In parallel, I worked on the development of new peptides against the human gastric mucin MUC5AC, linked with contrast agents or fluorescein. MUC5AC is secreted in the colonic mucus of cancer patients and is a specific marker of precancerous lesions. Then, the purpose of this work was to develop an early diagnostic tool of colorectal cancer (Funded by Guerbet: A French pharmaceutical industry and the Nord Pas-de-Calais region).
  • 2012-2014: Research assistant in Microbiology James Hutton Institute (ex: SCRI) (Scotland)/Mentor: Nicola Holden. I chose to go to Scotland for a postdoctoral position to stay in the exciting field of host-pathogen interaction in the unexplored area of human pathogens persistence on plants and expand my skills in molecular biology and microbiology. The work was focused on the molecular mechanisms underpinning foodborne outbreak associated pathogens with plants. We described, for the first time, how human pathogens could use plants as secondary host to target cattle or human.
  • 2014-2016: Research assistant in plant metabolomics University of Technology of Compiegne (GEC laboratory)/SAS PIVERT. decided to come back to France for this second postdoctoral positon to extend my knowledge on metabolomics and lipidomics. In this project, I explored the mechanism used by plants to distinguish usual and non-usual fatty acids on phospholipids (membrane lipids) as intermediates.
  • 2016- Present: Junior CNRS researcher in host-bacteria Interaction University of Technology of Compiegne (GEC laboratory)/CNRS. I am currently working on bacterial flagella adhesion on plant and mammal cells. Plasma membrane lipids and cytoskeletal proteins are directly involved in flagellar molecular recognition to be stuck on host cell surfaces. At the same time, I am focusing on the metabolic cost for Escherichia coli O157:H7 to adapt to environmental conditions (outside animal reservoir) like temperature.
 
Personal interests

Tarantulas breeding and study. Molecular identification and phylogenetical analysis of Southeast Asia tarantula species. Interest in gardening with a focus on cold hardy bamboos.
Yannick Rossez

Contacts

Office: CR F202B

Tel: +33 (0)3 44 23 46 87

yannick.rossez@utc.fr
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